29 травня правоохоронні органи України повідомили, що Бабченка, який покинув Росію на початку 2017 року, було застрелено на порозі своєї квартири в Києві. 30 травня стало відомо, що вбивство журналіста було інсценуванням у межах спецоперації СБУ.
У відомстві заявили, що для замаху на Бабченка спецслужби РФ завербували громадянина України і заплатили йому $40 тис. У Києві затримали ймовірного організатора замаху Бориса Германа. 31 травня Шевченківський райсуд Києва обрав для нього запобіжний захід у вигляді тримання під вартою на 60 діб без права застави.
1 червня генпрокурор України Юрій Луценко заявив, що завдяки імітації вбивства Бабченка слідство одержало список із 47 осіб, яких також планували вбити.