Шеремет загинув 20 липня 2016 року в Києві внаслідок підриву машини, яка належала співзасновниці видання "Українська правда", цивільній дружині журналіста Олені Притулі. Прокуратура кваліфікувала інцидент як умисне вбивство, вчинене способом, небезпечним для життя багатьох людей.
Слідство розглядало чотири версії мотивів убивства Шеремета: професійну діяльність, особисті неприязні стосунки, дестабілізацію ситуації в Україні, помилкове вбивство (замість Притули).
20 липня 2018 року заступник голови Нацполіції В'ячеслав Аброськін заявив, що "людину, яка може бути причетною до вбивства Шеремета, встановлено, але не ідентифіковано".
У листопаді 2018 року в ГПУ заявили, що поки нікого не повідомили про підозру і нікого не затримали.
19 липня 2019 року стало відомо, що у справі про вбивство Шеремета допитали колишнього генерального прокурора України Віктора Шокіна. Директор департаменту комунікацій Міністерства внутрішніх справ Артем Шевченко сказав, що слідчі не встановили підозрюваних у вбивстві журналіста.