Бабченко заявив, що пів року тому обіцяв виїхати, "якщо Україна обере "кандидата Х". Він також пов'язав переїзд із поверненням в Україну колишнього заступника глави Адміністрації Президента України Андрія Портнова.
За словами журналіста, він поїхав в Ізраїль.
У лютому 2017 року Бабченко виїхав із РФ у Прагу. За його словами, він вирішив покинути Росію після отримання інформації, що "товариші" вирішують, чи заводити на нього кримінальну справу і саджати. Журналіст деякий час перебував у Чехії, а влітку 2017 року з родиною переїхав до Києва. Він вів авторську програму на телеканалі ATR.
29 травня 2018 року з'явилася інформація, що в журналіста Бабченка стріляли в під'їзді його будинку. Він нібито помер у машині "швидкої". У поліції повідомили, що вбивця журналіста – професійний кілер.
30 травня стало відомо, що вбивство журналіста було інсценуванням у межах спецоперації СБУ.
Одного з організаторів замаху, Бориса Германа, затримали 30 травня в Києві. 31 травня він заявив у суді, що його знайомий В'ячеслав Пивоварник, який працює в "приватному фонді президента РФ Володимира Путіна" і відповідає за організацію терористичних актів на території України, дав йому список із 30 кандидатів на ліквідацію.
21 серпня тодішній генпрокурор Юрій Луценко заявив, що Герман погодився на угоду зі слідством. 1 вересня стало відомо, що його засуджено на чотири з половиною роки позбавлення волі.