Насірова підозрюють у зловживанні владою і службовим становищем, що спричинило збитки на суму майже 2 млрд грн. За даними слідства, на посаді керівника Державної фіскальної служби (ДФС) він ухвалював рішення в інтересах позафракційного депутата-втікача Олександра Онищенка, щодо якого розслідують провадження за підозрою в махінаціях із газом.
2 березня 2017 року Насірова затримали в лікарні "Феофанія" в Києві. 7 березня Солом'янський районний суд обрав йому запобіжний захід у вигляді тримання під вартою з можливістю внесення застави 100 млн грн. 16 березня Насіров вийшов на волю після того, як його дружина внесла за нього необхідну заставу.
Справу Насірова заслуховують у Шевченківському районному суді Києва. 7 грудня 2017 року прокурори Спеціалізованої антикорупційної прокуратури почали зачитувати повний текст обвинувального акта. Матеріали справи містяться на 774 сторінках.
31 січня 2018 року Кабмін звільнив Насірова з посади голови ДФС. У лютому чиновник оскаржив звільнення. 11 грудня Окружний адміністративний суд столиці визнав протиправним та скасував розпорядження уряду про звільнення Насірова й ухвалив виплатити йому понад 180 тис. грн за вимушений прогул. У Кабінеті Міністрів України пообіцяли оскаржити це рішення.