У СБУ заявили, що проводять слідчо-оперативні дії в межах кримінального провадження, яке відкрито за ст. 161 Кримінального кодексу України (порушення рівноправності громадян залежно від їхньої расової, національної належності, релігійних переконань, інвалідності та за іншими ознаками).
Детальну інформацію у СБУ пообіцяли надати пізніше.
За інформацією LB.ua, митрополит потрапив у поле зору СБУ через публікацію матеріалів із закликом до міжконфесійної ворожнечі. Також йому інкримінують обвинувачення за ст. 111 Кримінального кодексу України (державна зрада) та 111-1 (колабораційна діяльність).
Керівник інформаційного відділу УПЦ митрополит Климент сказав, що Іонафан проходить у справі як свідок.