Монтаньє помер 8 лютого в оточенні дітей. 2008 року він і його колега Франсуаза Барре-Сінусі здобули Нобелівську премію з медицини за те, що 1983 року було відкрито вірус імунодефіциту людини.
Він усе своє життя працював разом із найбільшими науковими інститутами світу. Почесний директор із досліджень Національного центру наукових досліджень, професор Інституту Пастера, директор Центру молекулярної та клітинної біології коледжу Квінс (є частиною Міського університету Нью-Йорка), директор дослідницького інституту Шанхайського університету Цзяотун.
Газета Libertation зазначає, що, незважаючи на Нобелівську премію, Монтаньє критикували в науковій спільноті. 2009 року – за рік після здобуття Нобелівської премії – він відстоював ідею про те, що гарна імунна система може позбутися ВІЛ "протягом кількох тижнів" і що гарна дієта, збагачена антиоксидантами, може наражати вірус на небезпеку.
Згодом Монтаньє стверджував, що порушення аутистичного спектра мають бактеріальне походження і їх можна лікувати антибіотиками. 2017 року він висловив кілька антивакцинаторських тез, таких як зв'язок між вакцинацією і синдромом раптової дитячої смерті.