Сейсембаєв народився 1966 року у Джезказганській області Казахстану в сім'ї чабана. Закінчив Казахський державний університет (спеціальність – правознавство).
1991 року заснував приватну комерційну фірму "Сеймар комерція", яка експортувала казахську пшеницю у країни СНД. Пізніше створив корпорацію "Сеймар", яка займалася виробництвом і продажем продукції птахівництва.
У 2000-ні бізнесмен став акціонером і головою "Альянс Банку", який входив до п'ятірки найбільших банків Казахстану, його вважали одним із системотвірних, нагадало "Радио Азаттык". 2009 року банк було націоналізовано, а Сейсембаєва обвинуватили в розкраданні та відмиванні грошей. Він виїхав за кордон, але після одержання "гарантій недоторканності" повернувся назад, зазначив казахстанський Forbes.
Протягом останніх років Сейсембаєв займається інвестиціями. 2019 року він увійшов під №33 до рейтингу 50 найвпливовіших бізнесменів Казахстану, складеного Forbes.
У серпні 2020 року експрезидент Грузії, голова українського Виконавчого комітету реформ Михайло Саакашвілі відрекомендував Сейсембаєва як свого потенційного партнера в діяльності Офісу простих рішень і результатів. "У сферу відповідальності Маргулана буде входити підвищення ефективності процесів забезпечення реформ і законопроєктів, а також уся міжнародна діяльність офісу", – повідомив він. В інтерв'ю Бацман бізнесмен розповів, що працює в Офісі реформ на волонтерських засадах.