Главою БЕБ за підсумками конкурсу призначили в серпні 2021 року Вадима Мельника, який до цього очолював Державну фіскальну службу.
У жовтні 2022 року нардеп від "Слуги народу", голова комітету з питань фінансів, податкової та митної політики Данило Гетманцев заявив, що реформа, унаслідок якої було створено БЕБ, провалилася, повідомляла "Судово-юридична газета". На його думку, бюро "провалилося з основних питань, якими займалася податкова міліція", і "не відбулося як аналітичний орган і взагалі як орган", з огляду на недостатній набір персоналу.
У лютому 2023 року податковий комітет Верховної Ради визнав роботу БЕБ незадовільною. Членкиня комітету, нардепка від "Слуги народу" Ольга Василевська-Смаглюк заявила, що це "перший крок до перезавантаження БЕБ". За її словами, очікують на проведення нового конкурсу на керівні посади бюро за участю міжнародних експертів конкурсної комісії й повну переатестацію всіх працівників БЕБ.
Реформа БЕБ, зокрема очищення органу, є вимогою програми фінансування від МВФ, а також програми Ukraine Facility від ЄС і прямої бюджетної підтримки від США.