Богдан очолював адміністрацію Володимира Зеленського (пізніше АП було перейменовано на Офіс президента) із травня 2019 року до лютого 2020-го.
11 лютого глава держави звільнив Богдана, призначивши на його місце Андрія Єрмака, який до цього працював помічником президента. В ОПУ запевнили, що зміна керівництва офісу не вплине на політичний курс держави. Богдан свою відставку не коментував, але перед його звільненням Зеленський говорив, що в його команді є конфлікти, які заважають працювати. У березні президент говорив, що звільнення пов'язане з "людськими відносинами".
2 березня Андрій Богдан заявив, що повертається до адвокатської практики.