За даними видання, Шапошников у 1983 році закінчив інженерний факультет Бакинського військового командного училища, три роки (1983–1986) воював в Афганістані, 1985 року одружився з киянкою Оленою, яка працювала тоді в Бакинському фізичному інституті. 1987 року Шапошникова скерували до Чехословаччини, де він служив командиром мотострілецької роти в Єлсаві. За три роки його військова кар'єра формально завершилася. У лютому 1989 року Шапошникова виключили з КПРС і піддали осуду з боку його командування за "неодноразові розкрадання бензину й акумуляторів з армії", ідеться в розслідуванні.
1990 року його звільнили з військової служби, формально за станом здоров'я, і скерували резервістом до Києва. Менш ніж за рік, одразу після того, як радянські війська вийшли із Чехословаччини, Шапошников повернувся у країну, де прийшов до поліцейської дільниці міста Зволен і попросив політичного притулку. Видання пише, що він приховав факт служби в Афганістані й надав підроблене свідоцтво про народження сина своєї дружини від першого шлюбу, видавши себе за його батька. Дружина Шапошникова також заявила, що здала свій український паспорт, але, як стверджують, використовувала його й далі для поїздок у Росію й Україну.
Після кількох відмов Шапошникови набули чеського громадянства: чоловік – 1999 року, а дружина – 2004 року.
На початку 2000-х Шапошников познайомився з Петром Бернатіком, колишнім секретним агентом чехословацького апарату держбезпеки. Найбільшим бізнесом Бернатіка з торгівлі зброєю була група Imex, значна частина клієнтів якої була в тих регіонах світу, де все ще використовували зброю радянських часів і де були потрібні відповідні боєприпаси. Шапошникови почали працювати в цій групі і згодом улаштували туди своїх дітей.
2009 року Шапошникови купили у Греції віллу, яку, за даними The Insider, використовували співробітники ГРУ як явочну квартиру. Деякі візити збігалися за часом із місіями цього підрозділу в регіоні. Шапошникови збирали для них інформацію про військові постачання й допомагали їм улаштовувати диверсії, такі як вибухи складів боєприпасів у Чехії й отруєння болгарського зброяра Еміліана Гебрева.
Співробітник російської в/ч 29155 (ГРУ) Олексій Капінос 25 квітня 2014 року прилітав у Салоніки за дипломатичним паспортом (пізніше чеським слідчим Шапошников назвав Капіноса "другом сім'ї"). За день до цього троє його колег із в/ч 29155 прибули до Болгарії і, згідно зі спільним розслідуванням The Insider і Bellingcat, яке пізніше підтвердив обвинувальний висновок болгарської прокуратури, отруїли Гебрева бойовою отруйною речовиною. Гебрев розповів The Insider, що Шапошникови познайомилися з ним ще у 2012 році й активно нав'язували спілкування, хоча жодних спільних бізнес-проєктів у них не було.
The Insider пише, що у 2014 році Шапошникови організували візит співробітників ГРУ Олександра Мішкіна й Анатолія Чепіги, щоб ті з підробленими паспортами на імена Руслан Табаров і Микола Попа могли відвідати склад у Врбетіце (Чехія), де зберігали куплені Гебревим снаряди. У день їхньої появи на складі №12 стався потужний вибух, загинуло двоє співробітників складу.
Також, за даними The Insider, Шапошникова таємно отримала російський паспорт із діапазону номерів, зарезервованих для в/ч 29155.
2022 року журналістам Česká televize вдалося поговорити із Шапошниковим. Тоді він заперечував зв'язки з російськими спецслужбами. "Що означає "російський агент"? Я не знаю жодних агентів. Підозрілих російських агентів у Європі стільки, що ми здивувалися б, якби всіх їх перерахували".
Шапошниковими нещодавно зацікавилися чеські слідчі. Після цього Шапошников у лютому 2024 року раптово помер від серцевого нападу. За даними The Insider, після того як сімейством зацікавилася чеська влада, він в очікуванні арешту став зловживати алкоголем і нехтувати ліки. Дружина Шапошникова заявила про те, що її переслідують через російське коріння (її батьки, згідно з публікацією The Insider, досі можуть жити в Києві).