В интервью изданию "ГОРДОН" глава украинской таможни в 2009–2010 и 2014–2015 годах Анатолий Макаренко признался, что во времена СССР едва не погиб вместе с экипажем на подводной лодке.
"Я в советские времена служил на подводной лодке. Уже пришел приказ о моем увольнении с флота, но приказ по части еще не был подписан. Сижу на чемоданах, семья в Киеве и я мыслями с ней. Тут в море выходит лодка, но заболел один из офицеров. Пошел я. Поход оказался коротким, но ярким", – рассказал Макаренко.
По его словам, во время погружения на подводной лодке произошел пожар и начались проблемы с реактором.
"Все худшее, что могло произойти с лодкой и экипажем, произошло – проблемы с реактором, потеря глубины, пожар. Была ситуация, когда командир лодки в сердцах крикнул: "Ну все, пацаны, довы...бывались!" Я вызвал одного из старших офицеров: "Можете тонуть, гореть, наслаждаться своим реактором, но верните меня на базу, я уже почти гражданский!" Все закончилось благополучно", – отметил Макаренко.
На совещании по борьбе с контрабандой президент спросил: "Кто участвует в этом безобразии?" Я ответил: "Все участники регаты находятся в зале". Полная версия интервью с Анатолием Макаренко
Летом 2010 года, при президенте Викторе Януковиче, Макаренко арестовали по обвинению в незаконном таможенном оформлении природного газа компании "РосУкрЭнерго", принадлежащей бизнесмену Дмитрию Фирташу. Макаренко провел один год и 13 дней в Лукьяновском СИЗО. Летом 2012 года экс-глава таможни был приговорен к четырем годам лишения свободы условно.
3 марта 2014 года, после бегства Януковича и победы Евромайдана, по решению Печерского районного суда города Киева Макаренко был освобожден от уголовной ответственности и признан несудимым.
5 июня 2014 года Макаренко был назначен заместителем председателя Государственной фискальной службы Украины, курировал таможенное направление. Был снят с должности спустя почти 10 месяцев, 23 марта 2015 года.