27 июня 2017 года в Соломенском районе Киева был взорван автомобиль, в котором находился Шаповал.
СМИ писали, что погибший офицер был командиром глубинной разведки и добывал доказательства причастности России к вооруженной агрессии против Украины.
7 сентября 2017 года президент Украины Петр Порошенко присвоил Шаповалу звание Героя Украины (посмертно).
17 апреля 2019 года глава СБУ Василий Грицак заявил, что теракт в результате которого погиб Шаповал, раскрыт. По данным следствия, его совершила одна из диверсионных групп, направленных в Украину из России. Исполнителем, по словам Грицака, является Олег Шутов, который через час после закладки взрывного устройства под автомобиль разведчика, выехал с территории Украины. Сейчас он, вероятно, скрывается на оккупированной части Донбасса.
Организатором убийств Шаповала и офицера украинских спецслужб Александра Хараберюша является генерал-лейтенант ФСБ Дмитрий Минаев, заявили в СБУ.